edgeR & DESeq2
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통계 & 머신러닝/생물정보통계 모델
Intro `edgeR`과 `DESeq2`는 RNAseq downstream analysis를 하다 보면 한번쯤은 보게되는 논문입니다. 두 가지 모두 `biomarker selection`에 대한 방법론과 해석을 제시합니다. 먼저 `edgeR`(2010)이 나오고 `DESeq2`(2014)가 나왔으며 두 논문 citation수가 (2022/10/12기준) 각각 27575회, 42124회 입니다. 엄청난 파워가 있는 논문들로 아직까지 커뮤니티에 질문과 답변이 활발하게 올라오고 있습니다. 이 논문들은 `biomarker selection`을 위한 `Differentially Expressed Gene(DEG)` 분석 논문입니다. DEG: control(normal healthy group)과 case(..